RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496569.1

HDLBP-246, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-246ENST00000496569 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.22■■■□□ 2.43
HDLBP-246ENST00000496569 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.99■■□□□ 1.91
HDLBP-246ENST00000496569 ABCC9O60706 1549 aa26.7■■□□□ 1.86
HDLBP-246ENST00000496569 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.48■■□□□ 1.67
HDLBP-246ENST00000496569 NACADO15069 1562 aa25.36■■□□□ 1.65
HDLBP-246ENST00000496569 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.36■■□□□ 1.65
HDLBP-246ENST00000496569 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
HDLBP-246ENST00000496569 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.12■■□□□ 1.61
HDLBP-246ENST00000496569 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.05■■□□□ 1.6
HDLBP-246ENST00000496569 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.9■■□□□ 1.58
HDLBP-246ENST00000496569 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
HDLBP-246ENST00000496569 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.82■■□□□ 1.56
HDLBP-246ENST00000496569 SCRIBQ14160 1630 aa24.72■■□□□ 1.55
HDLBP-246ENST00000496569 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.69■■□□□ 1.54
HDLBP-246ENST00000496569 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.32■■□□□ 1.48
HDLBP-246ENST00000496569 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
HDLBP-246ENST00000496569 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.13■■□□□ 1.45
HDLBP-246ENST00000496569 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.94■■□□□ 1.42
HDLBP-246ENST00000496569 SMARCA4P51532 1647 aa23.55■■□□□ 1.36
HDLBP-246ENST00000496569 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.42■■□□□ 1.34
HDLBP-246ENST00000496569 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HDLBP-246ENST00000496569 NCAPD3P42695 1498 aa23.37■■□□□ 1.33
HDLBP-246ENST00000496569 SMARCA2P51531 1590 aa23.35■■□□□ 1.33
HDLBP-246ENST00000496569 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.35■■□□□ 1.33
HDLBP-246ENST00000496569 HMGXB3Q12766 1538 aa23.29■■□□□ 1.32
HDLBP-246ENST00000496569 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.24■■□□□ 1.31
HDLBP-246ENST00000496569 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HDLBP-246ENST00000496569 WIZO95785 1651 aa23.15■■□□□ 1.3
HDLBP-246ENST00000496569 NESP48681 1621 aa23.07■■□□□ 1.28
HDLBP-246ENST00000496569 ERCC6Q03468 1493 aa22.96■■□□□ 1.27
HDLBP-246ENST00000496569 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HDLBP-246ENST00000496569 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.85■■□□□ 1.25
HDLBP-246ENST00000496569 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.84■■□□□ 1.25
HDLBP-246ENST00000496569 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
HDLBP-246ENST00000496569 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HDLBP-246ENST00000496569 CUX2O14529 1486 aa22.73■■□□□ 1.23
HDLBP-246ENST00000496569 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.69■■□□□ 1.22
HDLBP-246ENST00000496569 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.64■■□□□ 1.21
HDLBP-246ENST00000496569 CFTRP13569 1480 aa22.54■■□□□ 1.2
HDLBP-246ENST00000496569 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.52■■□□□ 1.2
HDLBP-246ENST00000496569 PRDM2Q13029 1718 aa22.51■■□□□ 1.19
HDLBP-246ENST00000496569 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.5■■□□□ 1.19
HDLBP-246ENST00000496569 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.5■■□□□ 1.19
HDLBP-246ENST00000496569 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.49■■□□□ 1.19
HDLBP-246ENST00000496569 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.46■■□□□ 1.19
HDLBP-246ENST00000496569 WDR62O43379 1518 aa22.45■■□□□ 1.18
HDLBP-246ENST00000496569 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HDLBP-246ENST00000496569 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HDLBP-246ENST00000496569 TOPBP1Q92547 1522 aa22.13■■□□□ 1.13
HDLBP-246ENST00000496569 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.09■■□□□ 1.13
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HDLBP-246ENST00000496569 IFT140Q96RY7 1462 aa21.98■■□□□ 1.11
HDLBP-246ENST00000496569 ABCC8Q09428 1581 aa21.98■■□□□ 1.11
HDLBP-246ENST00000496569 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HDLBP-246ENST00000496569 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HDLBP-246ENST00000496569 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
HDLBP-246ENST00000496569 CUX1P39880 1505 aa21.92■■□□□ 1.1
HDLBP-246ENST00000496569 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.88■■□□□ 1.09
HDLBP-246ENST00000496569 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.86■■□□□ 1.09
HDLBP-246ENST00000496569 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.095e-7■■■■■ 27.6
HDLBP-246ENST00000496569 SOGA1O94964 1423 aa21.78■■□□□ 1.08
HDLBP-246ENST00000496569 CHD1O14646 1710 aa21.77■■□□□ 1.08
HDLBP-246ENST00000496569 WDR97A6NE52 1622 aa21.77■■□□□ 1.07
HDLBP-246ENST00000496569 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HDLBP-246ENST00000496569 OSCARQ8IYS5 282 aa21.71■■□□□ 1.07
HDLBP-246ENST00000496569 SYNJ1O43426 1573 aa21.7■■□□□ 1.06
HDLBP-246ENST00000496569 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.67■■□□□ 1.06
HDLBP-246ENST00000496569 PBRM1Q86U86 1689 aa21.66■■□□□ 1.06
HDLBP-246ENST00000496569 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.64■■□□□ 1.05
HDLBP-246ENST00000496569 TOP2BQ02880 1626 aa21.63■■□□□ 1.05
HDLBP-246ENST00000496569 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
HDLBP-246ENST00000496569 TRIM41Q8WV44 630 aa21.6■■□□□ 1.05
HDLBP-246ENST00000496569 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.59■■□□□ 1.05
HDLBP-246ENST00000496569 FBLN2P98095 1184 aa21.59■■□□□ 1.05
HDLBP-246ENST00000496569 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.58■■□□□ 1.04
HDLBP-246ENST00000496569 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.58■■□□□ 1.04
HDLBP-246ENST00000496569 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.58■■□□□ 1.04
HDLBP-246ENST00000496569 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.58■■□□□ 1.04
HDLBP-246ENST00000496569 GRIN2BQ13224 1484 aa21.55■■□□□ 1.04
HDLBP-246ENST00000496569 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.55■■□□□ 1.04
HDLBP-246ENST00000496569 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
HDLBP-246ENST00000496569 ARHGEF11O15085 1522 aa21.5■■□□□ 1.03
HDLBP-246ENST00000496569 SYNJ2O15056 1496 aa21.45■■□□□ 1.02
HDLBP-246ENST00000496569 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.43■■□□□ 1.02
HDLBP-246ENST00000496569 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HDLBP-246ENST00000496569 ADAMTS12P58397 1594 aa21.41■■□□□ 1.02
HDLBP-246ENST00000496569 ARAP1Q96P48 1450 aa21.32■■□□□ 1
HDLBP-246ENST00000496569 GRIN2AQ12879 1464 aa21.32■■□□□ 1
HDLBP-246ENST00000496569 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.3■■□□□ 1
HDLBP-246ENST00000496569 CEP170Q5SW79 1584 aa21.3■■□□□ 1
HDLBP-246ENST00000496569 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.26■□□□□ 0.99
HDLBP-246ENST00000496569 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.25■□□□□ 0.99
HDLBP-246ENST00000496569 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.21■□□□□ 0.99
HDLBP-246ENST00000496569 NUP160Q12769 1436 aa21.21■□□□□ 0.99
HDLBP-246ENST00000496569 KIF27Q86VH2 1401 aa21.14■□□□□ 0.98
HDLBP-246ENST00000496569 SHROOM2Q13796 1616 aa21.13■□□□□ 0.97
HDLBP-246ENST00000496569 CUL7Q14999 1698 aa21.12■□□□□ 0.97
HDLBP-246ENST00000496569 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.11■□□□□ 0.97
HDLBP-246ENST00000496569 IGF1RP08069 1367 aa21.1■□□□□ 0.97
HDLBP-246ENST00000496569 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
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