RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.2■■■■■ 7.07
PTPRA-208ENST00000455631 ABCC9O60706 1549 aa54.08■■■■■ 6.25
PTPRA-208ENST00000455631 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.45■■■■■ 6.15
PTPRA-208ENST00000455631 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.2■■■■■ 5.79
PTPRA-208ENST00000455631 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.18■■■■■ 5.78
PTPRA-208ENST00000455631 NACADO15069 1562 aa50.65■■■■■ 5.7
PTPRA-208ENST00000455631 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.27■■■■■ 5.64
PTPRA-208ENST00000455631 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.21■■■■■ 5.63
PTPRA-208ENST00000455631 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.07■■■■■ 5.61
PTPRA-208ENST00000455631 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.7■■■■■ 5.55
PTPRA-208ENST00000455631 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.69■■■■■ 5.54
PTPRA-208ENST00000455631 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.94■■■■■ 5.43
PTPRA-208ENST00000455631 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.94■■■■■ 5.43
PTPRA-208ENST00000455631 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.83■■■■■ 5.41
PTPRA-208ENST00000455631 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.82■■■■■ 5.41
PTPRA-208ENST00000455631 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.76■■■■■ 5.4
PTPRA-208ENST00000455631 SCRIBQ14160 1630 aa48.71■■■■■ 5.39
PTPRA-208ENST00000455631 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.56■■■■■ 5.36
PTPRA-208ENST00000455631 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.49■■■■■ 5.19
PTPRA-208ENST00000455631 CUX2O14529 1486 aa46.85■■■■■ 5.09
PTPRA-208ENST00000455631 ERCC6Q03468 1493 aa46.76■■■■■ 5.08
PTPRA-208ENST00000455631 NCAPD3P42695 1498 aa46.73■■■■■ 5.07
PTPRA-208ENST00000455631 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.52■■■■■ 5.04
PTPRA-208ENST00000455631 SMARCA2P51531 1590 aa46.39■■■■■ 5.02
PTPRA-208ENST00000455631 HMGXB3Q12766 1538 aa46.38■■■■■ 5.01
PTPRA-208ENST00000455631 SMARCA4P51532 1647 aa46.36■■■■■ 5.01
PTPRA-208ENST00000455631 NESP48681 1621 aa46.26■■■■■ 5
PTPRA-208ENST00000455631 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.08■■■■■ 4.97
PTPRA-208ENST00000455631 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.02■■■■■ 4.96
PTPRA-208ENST00000455631 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
PTPRA-208ENST00000455631 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.87■■■■■ 4.93
PTPRA-208ENST00000455631 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.84■■■■■ 4.93
PTPRA-208ENST00000455631 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.69■■■■■ 4.9
PTPRA-208ENST00000455631 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.62■■■■■ 4.89
PTPRA-208ENST00000455631 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.57■■■■■ 4.89
PTPRA-208ENST00000455631 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.29■■■■■ 4.84
PTPRA-208ENST00000455631 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.24■■■■■ 4.83
PTPRA-208ENST00000455631 TRIM41Q8WV44 630 aa45.23■■■■■ 4.83
PTPRA-208ENST00000455631 WDR62O43379 1518 aa45.16■■■■■ 4.82
PTPRA-208ENST00000455631 WIZO95785 1651 aa45.08■■■■■ 4.81
PTPRA-208ENST00000455631 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.95■■■■■ 4.79
PTPRA-208ENST00000455631 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.82■■■■■ 4.77
PTPRA-208ENST00000455631 CFTRP13569 1480 aa44.65■■■■■ 4.74
PTPRA-208ENST00000455631 OSCARQ8IYS5 282 aa44.56■■■■■ 4.72
PTPRA-208ENST00000455631 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
PTPRA-208ENST00000455631 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
PTPRA-208ENST00000455631 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
PTPRA-208ENST00000455631 PRDM2Q13029 1718 aa44.24■■■■■ 4.67
PTPRA-208ENST00000455631 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.13■■■■■ 4.66
PTPRA-208ENST00000455631 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.13■■■■■ 4.66
PTPRA-208ENST00000455631 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.13■■■■■ 4.66
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.05■■■■■ 4.64
PTPRA-208ENST00000455631 IFT140Q96RY7 1462 aa44.04■■■■■ 4.64
PTPRA-208ENST00000455631 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.92■■■■■ 4.62
PTPRA-208ENST00000455631 ARHGEF11O15085 1522 aa43.91■■■■■ 4.62
PTPRA-208ENST00000455631 TOPBP1Q92547 1522 aa43.9■■■■■ 4.62
PTPRA-208ENST00000455631 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
PTPRA-208ENST00000455631 ABCC8Q09428 1581 aa43.73■■■■■ 4.59
PTPRA-208ENST00000455631 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.7■■■■■ 4.59
PTPRA-208ENST00000455631 CHD1O14646 1710 aa43.63■■■■■ 4.58
PTPRA-208ENST00000455631 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.59■■■■■ 4.57
PTPRA-208ENST00000455631 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
PTPRA-208ENST00000455631 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.56■■■■■ 4.56
PTPRA-208ENST00000455631 ARAP1Q96P48 1450 aa43.44■■■■■ 4.54
PTPRA-208ENST00000455631 FBLN2P98095 1184 aa43.42■■■■■ 4.54
PTPRA-208ENST00000455631 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
PTPRA-208ENST00000455631 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
PTPRA-208ENST00000455631 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.26■■■■■ 4.52
PTPRA-208ENST00000455631 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
PTPRA-208ENST00000455631 SOGA1O94964 1423 aa43.18■■■■■ 4.5
PTPRA-208ENST00000455631 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.13■■■■■ 4.5
PTPRA-208ENST00000455631 WDR97A6NE52 1622 aa43.07■■■■■ 4.48
PTPRA-208ENST00000455631 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.07■■■■■ 4.48
PTPRA-208ENST00000455631 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.06■■■■■ 4.48
PTPRA-208ENST00000455631 SYNJ1O43426 1573 aa43■■■■■ 4.47
PTPRA-208ENST00000455631 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
PTPRA-208ENST00000455631 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
PTPRA-208ENST00000455631 CUX1P39880 1505 aa42.92■■■■■ 4.46
PTPRA-208ENST00000455631 GRIN2BQ13224 1484 aa42.89■■■■■ 4.46
PTPRA-208ENST00000455631 SYNJ2O15056 1496 aa42.83■■■■■ 4.45
PTPRA-208ENST00000455631 PBRM1Q86U86 1689 aa42.76■■■■■ 4.44
PTPRA-208ENST00000455631 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.66■■■■■ 4.42
PTPRA-208ENST00000455631 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
PTPRA-208ENST00000455631 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.54■■■■■ 4.4
PTPRA-208ENST00000455631 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.51■■■■■ 4.4
PTPRA-208ENST00000455631 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.36■■■■■ 4.37
PTPRA-208ENST00000455631 GRIN2AQ12879 1464 aa42.36■■■■■ 4.37
PTPRA-208ENST00000455631 ADAMTS12P58397 1594 aa42.29■■■■■ 4.36
PTPRA-208ENST00000455631 CEP170Q5SW79 1584 aa42.26■■■■■ 4.36
PTPRA-208ENST00000455631 NUP160Q12769 1436 aa42.21■■■■■ 4.35
PTPRA-208ENST00000455631 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.21■■■■■ 4.35
PTPRA-208ENST00000455631 SHROOM2Q13796 1616 aa42.13■■■■■ 4.33
PTPRA-208ENST00000455631 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.08■■■■■ 4.33
PTPRA-208ENST00000455631 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.07■■■■■ 4.33
PTPRA-208ENST00000455631 TOP2BQ02880 1626 aa42.06■■■■■ 4.32
PTPRA-208ENST00000455631 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
PTPRA-208ENST00000455631 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.97■■■■■ 4.31
PTPRA-208ENST00000455631 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.95■■■■■ 4.31
PTPRA-208ENST00000455631 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
PTPRA-208ENST00000455631 JPH4Q96JJ6 628 aa41.74■■■■■ 4.27
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