Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRDNQ13061 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRDNQ13061 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRDNQ13061 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TRDNQ13061 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRDNQ13061 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
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