Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN1Q12860 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTN1Q12860 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN1Q12860 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN1Q12860 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTN1Q12860 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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