Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C1Q12789 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C1Q12789 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C1Q12789 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms