Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD47Q08722 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD47Q08722 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD47Q08722 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD47Q08722 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD47Q08722 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD47Q08722 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD47Q08722 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD47Q08722 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD47Q08722 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD47Q08722 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD47Q08722 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD47Q08722 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD47Q08722 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD47Q08722 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD47Q08722 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD47Q08722 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD47Q08722 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD47Q08722 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD47Q08722 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD47Q08722 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD47Q08722 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD47Q08722 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD47Q08722 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD47Q08722 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CD47Q08722 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD47Q08722 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CD47Q08722 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD47Q08722 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD47Q08722 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD47Q08722 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD47Q08722 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD47Q08722 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD47Q08722 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD47Q08722 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD47Q08722 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD47Q08722 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD47Q08722 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD47Q08722 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CD47Q08722 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD47Q08722 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD47Q08722 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD47Q08722 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD47Q08722 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD47Q08722 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD47Q08722 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD47Q08722 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD47Q08722 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD47Q08722 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD47Q08722 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD47Q08722 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD47Q08722 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD47Q08722 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD47Q08722 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD47Q08722 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD47Q08722 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD47Q08722 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD47Q08722 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD47Q08722 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD47Q08722 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD47Q08722 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD47Q08722 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD47Q08722 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD47Q08722 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD47Q08722 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD47Q08722 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD47Q08722 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD47Q08722 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD47Q08722 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD47Q08722 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD47Q08722 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CD47Q08722 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD47Q08722 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD47Q08722 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD47Q08722 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD47Q08722 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD47Q08722 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD47Q08722 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD47Q08722 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD47Q08722 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD47Q08722 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD47Q08722 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD47Q08722 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD47Q08722 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD47Q08722 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD47Q08722 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD47Q08722 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD47Q08722 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD47Q08722 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CD47Q08722 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD47Q08722 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD47Q08722 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD47Q08722 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD47Q08722 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD47Q08722 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD47Q08722 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD47Q08722 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD47Q08722 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CD47Q08722 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD47Q08722 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms