Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
EXOSC9Q06265 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
EXOSC9Q06265 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
EXOSC9Q06265 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
EXOSC9Q06265 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
EXOSC9Q06265 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EXOSC9Q06265 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EXOSC9Q06265 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EXOSC9Q06265 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.7 ms