Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TAP1Q03518 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAP1Q03518 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAP1Q03518 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAP1Q03518 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TAP1Q03518 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAP1Q03518 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAP1Q03518 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAP1Q03518 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAP1Q03518 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TAP1Q03518 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAP1Q03518 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAP1Q03518 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TAP1Q03518 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAP1Q03518 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
TAP1Q03518 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TAP1Q03518 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAP1Q03518 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAP1Q03518 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAP1Q03518 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAP1Q03518 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAP1Q03518 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TAP1Q03518 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms