Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX5P78411 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX5P78411 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX5P78411 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX5P78411 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX5P78411 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX5P78411 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX5P78411 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX5P78411 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX5P78411 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX5P78411 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX5P78411 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX5P78411 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX5P78411 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX5P78411 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX5P78411 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX5P78411 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX5P78411 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX5P78411 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX5P78411 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX5P78411 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX5P78411 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRX5P78411 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX5P78411 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX5P78411 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRX5P78411 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRX5P78411 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX5P78411 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX5P78411 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRX5P78411 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX5P78411 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX5P78411 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRX5P78411 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX5P78411 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX5P78411 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX5P78411 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX5P78411 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRX5P78411 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX5P78411 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX5P78411 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRX5P78411 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX5P78411 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX5P78411 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX5P78411 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX5P78411 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRX5P78411 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX5P78411 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX5P78411 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX5P78411 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRX5P78411 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX5P78411 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX5P78411 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX5P78411 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX5P78411 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX5P78411 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRX5P78411 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX5P78411 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX5P78411 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX5P78411 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRX5P78411 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
IRX5P78411 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX5P78411 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX5P78411 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRX5P78411 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX5P78411 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX5P78411 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX5P78411 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRX5P78411 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX5P78411 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRX5P78411 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IRX5P78411 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX5P78411 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRX5P78411 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX5P78411 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX5P78411 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRX5P78411 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX5P78411 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms