Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PITX1P78337 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PITX1P78337 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PITX1P78337 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PITX1P78337 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PITX1P78337 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PITX1P78337 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PITX1P78337 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PITX1P78337 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PITX1P78337 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PITX1P78337 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PITX1P78337 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PITX1P78337 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PITX1P78337 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PITX1P78337 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PITX1P78337 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PITX1P78337 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PITX1P78337 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PITX1P78337 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PITX1P78337 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PITX1P78337 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PITX1P78337 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PITX1P78337 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PITX1P78337 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PITX1P78337 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PITX1P78337 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PITX1P78337 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PITX1P78337 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PITX1P78337 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PITX1P78337 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PITX1P78337 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PITX1P78337 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PITX1P78337 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PITX1P78337 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PITX1P78337 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PITX1P78337 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PITX1P78337 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PITX1P78337 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PITX1P78337 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PITX1P78337 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PITX1P78337 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PITX1P78337 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PITX1P78337 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PITX1P78337 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PITX1P78337 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PITX1P78337 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PITX1P78337 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PITX1P78337 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PITX1P78337 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PITX1P78337 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PITX1P78337 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PITX1P78337 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PITX1P78337 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PITX1P78337 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITX1P78337 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITX1P78337 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITX1P78337 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PITX1P78337 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PITX1P78337 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PITX1P78337 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PITX1P78337 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PITX1P78337 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PITX1P78337 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PITX1P78337 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PITX1P78337 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PITX1P78337 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITX1P78337 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITX1P78337 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITX1P78337 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITX1P78337 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITX1P78337 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITX1P78337 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PITX1P78337 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PITX1P78337 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PITX1P78337 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PITX1P78337 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PITX1P78337 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PITX1P78337 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PITX1P78337 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PITX1P78337 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PITX1P78337 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PITX1P78337 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PITX1P78337 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PITX1P78337 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PITX1P78337 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PITX1P78337 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PITX1P78337 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PITX1P78337 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PITX1P78337 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PITX1P78337 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PITX1P78337 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PITX1P78337 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PITX1P78337 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PITX1P78337 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PITX1P78337 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITX1P78337 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITX1P78337 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITX1P78337 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PITX1P78337 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITX1P78337 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms