Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NLRP12P59046 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP12P59046 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP12P59046 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NLRP12P59046 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP12P59046 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP12P59046 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms