Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LGALS4P56470 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LGALS4P56470 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LGALS4P56470 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LGALS4P56470 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LGALS4P56470 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LGALS4P56470 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LGALS4P56470 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS4P56470 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS4P56470 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LGALS4P56470 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LGALS4P56470 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGALS4P56470 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGALS4P56470 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGALS4P56470 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGALS4P56470 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms