Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARFIP1P53367 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARFIP1P53367 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARFIP1P53367 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.5 ms