Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR4P51679 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR4P51679 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR4P51679 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR4P51679 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR4P51679 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR4P51679 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR4P51679 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR4P51679 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR4P51679 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR4P51679 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR4P51679 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR4P51679 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR4P51679 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR4P51679 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR4P51679 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR4P51679 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR4P51679 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR4P51679 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR4P51679 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR4P51679 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR4P51679 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR4P51679 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR4P51679 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR4P51679 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR4P51679 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR4P51679 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR4P51679 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR4P51679 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR4P51679 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR4P51679 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR4P51679 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR4P51679 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR4P51679 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR4P51679 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCR4P51679 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCR4P51679 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCR4P51679 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCR4P51679 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR4P51679 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR4P51679 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR4P51679 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR4P51679 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR4P51679 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR4P51679 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR4P51679 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR4P51679 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR4P51679 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR4P51679 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR4P51679 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR4P51679 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR4P51679 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR4P51679 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR4P51679 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR4P51679 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR4P51679 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR4P51679 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR4P51679 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR4P51679 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR4P51679 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR4P51679 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR4P51679 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR4P51679 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR4P51679 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR4P51679 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR4P51679 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR4P51679 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR4P51679 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR4P51679 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR4P51679 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR4P51679 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR4P51679 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR4P51679 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR4P51679 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR4P51679 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR4P51679 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR4P51679 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR4P51679 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR4P51679 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR4P51679 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR4P51679 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR4P51679 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR4P51679 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms