Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC10P48553 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC10P48553 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC10P48553 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC10P48553 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms