Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABRB2P47870 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABRB2P47870 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRB2P47870 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRB2P47870 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRB2P47870 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GABRB2P47870 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRB2P47870 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRB2P47870 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRB2P47870 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRB2P47870 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRB2P47870 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABRB2P47870 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABRB2P47870 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GABRB2P47870 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABRB2P47870 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GABRB2P47870 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABRB2P47870 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms