Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GARSP41250 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GARSP41250 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GARSP41250 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GARSP41250 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GARSP41250 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GARSP41250 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GARSP41250 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GARSP41250 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GARSP41250 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GARSP41250 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GARSP41250 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GARSP41250 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GARSP41250 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GARSP41250 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GARSP41250 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GARSP41250 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GARSP41250 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GARSP41250 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GARSP41250 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GARSP41250 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GARSP41250 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GARSP41250 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GARSP41250 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GARSP41250 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GARSP41250 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GARSP41250 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GARSP41250 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GARSP41250 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GARSP41250 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GARSP41250 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GARSP41250 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GARSP41250 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GARSP41250 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GARSP41250 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GARSP41250 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GARSP41250 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GARSP41250 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GARSP41250 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GARSP41250 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GARSP41250 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GARSP41250 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GARSP41250 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GARSP41250 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GARSP41250 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GARSP41250 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GARSP41250 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GARSP41250 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GARSP41250 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GARSP41250 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GARSP41250 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GARSP41250 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GARSP41250 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GARSP41250 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GARSP41250 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GARSP41250 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GARSP41250 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GARSP41250 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GARSP41250 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GARSP41250 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GARSP41250 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GARSP41250 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GARSP41250 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GARSP41250 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GARSP41250 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GARSP41250 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GARSP41250 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GARSP41250 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GARSP41250 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GARSP41250 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GARSP41250 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GARSP41250 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GARSP41250 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GARSP41250 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GARSP41250 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GARSP41250 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GARSP41250 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GARSP41250 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GARSP41250 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GARSP41250 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GARSP41250 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GARSP41250 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GARSP41250 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GARSP41250 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GARSP41250 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GARSP41250 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GARSP41250 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GARSP41250 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GARSP41250 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GARSP41250 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GARSP41250 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GARSP41250 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GARSP41250 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GARSP41250 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GARSP41250 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GARSP41250 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GARSP41250 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GARSP41250 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GARSP41250 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GARSP41250 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms