Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PFN2P35080 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PFN2P35080 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PFN2P35080 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PFN2P35080 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PFN2P35080 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PFN2P35080 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PFN2P35080 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PFN2P35080 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFN2P35080 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFN2P35080 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFN2P35080 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFN2P35080 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFN2P35080 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFN2P35080 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFN2P35080 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PFN2P35080 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFN2P35080 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFN2P35080 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFN2P35080 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PFN2P35080 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFN2P35080 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFN2P35080 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFN2P35080 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFN2P35080 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFN2P35080 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFN2P35080 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PFN2P35080 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFN2P35080 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFN2P35080 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFN2P35080 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFN2P35080 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFN2P35080 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFN2P35080 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFN2P35080 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFN2P35080 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFN2P35080 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFN2P35080 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFN2P35080 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFN2P35080 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFN2P35080 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFN2P35080 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFN2P35080 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFN2P35080 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFN2P35080 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFN2P35080 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFN2P35080 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFN2P35080 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFN2P35080 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFN2P35080 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFN2P35080 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFN2P35080 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFN2P35080 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFN2P35080 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFN2P35080 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFN2P35080 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFN2P35080 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFN2P35080 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFN2P35080 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFN2P35080 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFN2P35080 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFN2P35080 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFN2P35080 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFN2P35080 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFN2P35080 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PFN2P35080 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PFN2P35080 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFN2P35080 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFN2P35080 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFN2P35080 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFN2P35080 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PFN2P35080 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFN2P35080 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFN2P35080 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFN2P35080 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PFN2P35080 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFN2P35080 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFN2P35080 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFN2P35080 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PFN2P35080 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFN2P35080 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PFN2P35080 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFN2P35080 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFN2P35080 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFN2P35080 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFN2P35080 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFN2P35080 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFN2P35080 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFN2P35080 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFN2P35080 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PFN2P35080 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFN2P35080 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFN2P35080 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFN2P35080 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFN2P35080 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFN2P35080 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFN2P35080 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFN2P35080 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFN2P35080 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PFN2P35080 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms