Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXCR5P32302 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CXCR5P32302 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CXCR5P32302 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms