Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2E2P29084 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E2P29084 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms