Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMO2P25791 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO2P25791 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO2P25791 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO2P25791 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO2P25791 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO2P25791 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO2P25791 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO2P25791 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO2P25791 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO2P25791 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO2P25791 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO2P25791 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO2P25791 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO2P25791 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO2P25791 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO2P25791 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO2P25791 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO2P25791 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO2P25791 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMO2P25791 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO2P25791 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO2P25791 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO2P25791 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO2P25791 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO2P25791 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO2P25791 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO2P25791 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO2P25791 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO2P25791 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO2P25791 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO2P25791 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO2P25791 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO2P25791 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO2P25791 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO2P25791 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO2P25791 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO2P25791 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO2P25791 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO2P25791 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO2P25791 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO2P25791 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO2P25791 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO2P25791 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO2P25791 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMO2P25791 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO2P25791 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO2P25791 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO2P25791 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO2P25791 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMO2P25791 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO2P25791 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO2P25791 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO2P25791 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMO2P25791 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO2P25791 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO2P25791 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO2P25791 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMO2P25791 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMO2P25791 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMO2P25791 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMO2P25791 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO2P25791 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMO2P25791 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO2P25791 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO2P25791 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO2P25791 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO2P25791 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO2P25791 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO2P25791 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO2P25791 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO2P25791 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO2P25791 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO2P25791 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO2P25791 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO2P25791 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO2P25791 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO2P25791 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO2P25791 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO2P25791 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO2P25791 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO2P25791 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO2P25791 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO2P25791 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO2P25791 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO2P25791 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO2P25791 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO2P25791 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO2P25791 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO2P25791 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO2P25791 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO2P25791 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO2P25791 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO2P25791 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO2P25791 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO2P25791 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO2P25791 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO2P25791 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO2P25791 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO2P25791 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms