Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LMO2P25791 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LMO2P25791 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
LMO2P25791 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
LMO2P25791 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
LMO2P25791 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LMO2P25791 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LMO2P25791 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LMO2P25791 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LMO2P25791 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMO2P25791 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LMO2P25791 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMO2P25791 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LMO2P25791 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMO2P25791 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMO2P25791 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LMO2P25791 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LMO2P25791 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMO2P25791 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LMO2P25791 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMO2P25791 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMO2P25791 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LMO2P25791 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMO2P25791 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LMO2P25791 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMO2P25791 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMO2P25791 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMO2P25791 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMO2P25791 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMO2P25791 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMO2P25791 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LMO2P25791 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LMO2P25791 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LMO2P25791 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMO2P25791 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMO2P25791 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMO2P25791 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LMO2P25791 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMO2P25791 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMO2P25791 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LMO2P25791 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMO2P25791 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LMO2P25791 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMO2P25791 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMO2P25791 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMO2P25791 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMO2P25791 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
LMO2P25791 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMO2P25791 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMO2P25791 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMO2P25791 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMO2P25791 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMO2P25791 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMO2P25791 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMO2P25791 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMO2P25791 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMO2P25791 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMO2P25791 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
LMO2P25791 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMO2P25791 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMO2P25791 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
LMO2P25791 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMO2P25791 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
LMO2P25791 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMO2P25791 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMO2P25791 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMO2P25791 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LMO2P25791 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LMO2P25791 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LMO2P25791 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMO2P25791 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LMO2P25791 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMO2P25791 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMO2P25791 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LMO2P25791 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMO2P25791 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMO2P25791 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMO2P25791 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LMO2P25791 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMO2P25791 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMO2P25791 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMO2P25791 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMO2P25791 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMO2P25791 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
LMO2P25791 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMO2P25791 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMO2P25791 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMO2P25791 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMO2P25791 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMO2P25791 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMO2P25791 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
LMO2P25791 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
LMO2P25791 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LMO2P25791 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMO2P25791 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LMO2P25791 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMO2P25791 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMO2P25791 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMO2P25791 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMO2P25791 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms