Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMA3P25788 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMA3P25788 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMA3P25788 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMA3P25788 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms