Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP5A1P25705 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP5A1P25705 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP5A1P25705 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5A1P25705 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP5A1P25705 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms