Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCN2P20062 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCN2P20062 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCN2P20062 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TCN2P20062 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCN2P20062 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCN2P20062 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCN2P20062 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCN2P20062 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCN2P20062 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCN2P20062 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCN2P20062 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCN2P20062 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCN2P20062 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCN2P20062 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCN2P20062 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCN2P20062 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCN2P20062 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCN2P20062 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCN2P20062 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCN2P20062 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCN2P20062 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCN2P20062 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCN2P20062 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCN2P20062 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCN2P20062 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCN2P20062 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCN2P20062 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCN2P20062 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCN2P20062 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCN2P20062 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TCN2P20062 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCN2P20062 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCN2P20062 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCN2P20062 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCN2P20062 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCN2P20062 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCN2P20062 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCN2P20062 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCN2P20062 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCN2P20062 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCN2P20062 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TCN2P20062 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCN2P20062 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCN2P20062 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCN2P20062 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCN2P20062 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCN2P20062 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCN2P20062 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TCN2P20062 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TCN2P20062 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCN2P20062 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCN2P20062 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCN2P20062 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TCN2P20062 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCN2P20062 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCN2P20062 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCN2P20062 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCN2P20062 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCN2P20062 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCN2P20062 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCN2P20062 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCN2P20062 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCN2P20062 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TCN2P20062 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCN2P20062 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCN2P20062 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCN2P20062 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCN2P20062 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCN2P20062 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCN2P20062 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCN2P20062 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCN2P20062 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCN2P20062 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCN2P20062 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCN2P20062 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCN2P20062 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TCN2P20062 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCN2P20062 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCN2P20062 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCN2P20062 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCN2P20062 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCN2P20062 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCN2P20062 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCN2P20062 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TCN2P20062 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCN2P20062 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCN2P20062 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCN2P20062 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCN2P20062 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCN2P20062 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCN2P20062 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCN2P20062 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCN2P20062 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCN2P20062 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCN2P20062 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCN2P20062 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCN2P20062 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCN2P20062 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCN2P20062 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms