Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RXRAP19793 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RXRAP19793 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RXRAP19793 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RXRAP19793 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RXRAP19793 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RXRAP19793 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RXRAP19793 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RXRAP19793 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RXRAP19793 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RXRAP19793 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RXRAP19793 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RXRAP19793 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RXRAP19793 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RXRAP19793 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RXRAP19793 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RXRAP19793 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RXRAP19793 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RXRAP19793 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RXRAP19793 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RXRAP19793 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RXRAP19793 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RXRAP19793 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RXRAP19793 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RXRAP19793 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RXRAP19793 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RXRAP19793 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RXRAP19793 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RXRAP19793 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RXRAP19793 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RXRAP19793 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RXRAP19793 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RXRAP19793 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RXRAP19793 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RXRAP19793 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RXRAP19793 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RXRAP19793 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RXRAP19793 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RXRAP19793 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RXRAP19793 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RXRAP19793 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RXRAP19793 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RXRAP19793 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RXRAP19793 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RXRAP19793 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RXRAP19793 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RXRAP19793 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RXRAP19793 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RXRAP19793 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RXRAP19793 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RXRAP19793 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RXRAP19793 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RXRAP19793 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RXRAP19793 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RXRAP19793 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RXRAP19793 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RXRAP19793 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RXRAP19793 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RXRAP19793 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RXRAP19793 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RXRAP19793 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RXRAP19793 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RXRAP19793 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RXRAP19793 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RXRAP19793 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RXRAP19793 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RXRAP19793 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RXRAP19793 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RXRAP19793 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RXRAP19793 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RXRAP19793 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RXRAP19793 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RXRAP19793 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RXRAP19793 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RXRAP19793 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RXRAP19793 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RXRAP19793 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RXRAP19793 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRAP19793 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRAP19793 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRAP19793 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRAP19793 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRAP19793 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RXRAP19793 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRAP19793 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRAP19793 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRAP19793 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRAP19793 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RXRAP19793 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RXRAP19793 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RXRAP19793 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RXRAP19793 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RXRAP19793 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RXRAP19793 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RXRAP19793 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RXRAP19793 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RXRAP19793 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RXRAP19793 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RXRAP19793 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RXRAP19793 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms