Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF1P09603 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF1P09603 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF1P09603 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF1P09603 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF1P09603 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF1P09603 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF1P09603 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF1P09603 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF1P09603 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF1P09603 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF1P09603 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF1P09603 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF1P09603 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF1P09603 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF1P09603 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF1P09603 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF1P09603 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF1P09603 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF1P09603 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF1P09603 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF1P09603 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF1P09603 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF1P09603 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF1P09603 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF1P09603 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF1P09603 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF1P09603 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF1P09603 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF1P09603 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF1P09603 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF1P09603 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF1P09603 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF1P09603 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF1P09603 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF1P09603 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF1P09603 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF1P09603 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF1P09603 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF1P09603 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF1P09603 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF1P09603 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF1P09603 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF1P09603 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF1P09603 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF1P09603 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF1P09603 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF1P09603 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF1P09603 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF1P09603 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF1P09603 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF1P09603 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF1P09603 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF1P09603 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CSF1P09603 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF1P09603 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF1P09603 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF1P09603 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF1P09603 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF1P09603 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF1P09603 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF1P09603 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF1P09603 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF1P09603 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF1P09603 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF1P09603 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF1P09603 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF1P09603 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF1P09603 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF1P09603 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF1P09603 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF1P09603 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF1P09603 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSF1P09603 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF1P09603 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF1P09603 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF1P09603 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF1P09603 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSF1P09603 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF1P09603 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF1P09603 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF1P09603 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF1P09603 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF1P09603 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSF1P09603 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1P09603 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1P09603 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1P09603 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1P09603 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1P09603 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1P09603 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1P09603 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1P09603 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1P09603 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1P09603 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1P09603 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1P09603 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1P09603 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1P09603 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1P09603 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 733.1 ms