Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HSP90AB1P08238 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
HSP90AB1P08238 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HSP90AB1P08238 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HSP90AB1P08238 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
HSP90AB1P08238 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms