Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-HP01893 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-HP01893 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HLA-HP01893 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-HP01893 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms