Protein–RNA interactions for Protein: P01717

IGLV3-25, Immunoglobulin lambda variable 3-25, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-25P01717 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
IGLV3-25P01717 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IGLV3-25P01717 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IGLV3-25P01717 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGLV3-25P01717 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms