Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPNE6O95741 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPNE6O95741 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CPNE6O95741 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CPNE6O95741 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms