Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM1O75626 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM1O75626 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM1O75626 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM1O75626 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM1O75626 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM1O75626 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM1O75626 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM1O75626 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM1O75626 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM1O75626 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM1O75626 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRDM1O75626 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PRDM1O75626 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRDM1O75626 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms