Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TULP3O75386 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TULP3O75386 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TULP3O75386 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TULP3O75386 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP3O75386 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP3O75386 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP3O75386 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP3O75386 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP3O75386 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TULP3O75386 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TULP3O75386 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP3O75386 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP3O75386 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP3O75386 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP3O75386 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP3O75386 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP3O75386 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP3O75386 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP3O75386 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP3O75386 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP3O75386 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP3O75386 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP3O75386 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP3O75386 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP3O75386 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP3O75386 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP3O75386 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP3O75386 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP3O75386 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP3O75386 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP3O75386 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP3O75386 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP3O75386 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP3O75386 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP3O75386 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP3O75386 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP3O75386 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP3O75386 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TULP3O75386 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP3O75386 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP3O75386 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP3O75386 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP3O75386 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP3O75386 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP3O75386 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP3O75386 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP3O75386 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP3O75386 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP3O75386 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP3O75386 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TULP3O75386 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP3O75386 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP3O75386 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP3O75386 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP3O75386 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP3O75386 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP3O75386 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TULP3O75386 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP3O75386 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP3O75386 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TULP3O75386 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP3O75386 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP3O75386 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP3O75386 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP3O75386 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP3O75386 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP3O75386 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP3O75386 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP3O75386 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP3O75386 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP3O75386 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP3O75386 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP3O75386 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP3O75386 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP3O75386 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP3O75386 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP3O75386 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP3O75386 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP3O75386 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP3O75386 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP3O75386 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP3O75386 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP3O75386 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP3O75386 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP3O75386 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP3O75386 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP3O75386 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP3O75386 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TULP3O75386 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TULP3O75386 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TULP3O75386 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TULP3O75386 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP3O75386 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP3O75386 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP3O75386 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP3O75386 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP3O75386 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP3O75386 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TULP3O75386 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms