Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP2O75044 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRGAP2O75044 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRGAP2O75044 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP2O75044 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms