Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MCM3APO60318 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCM3APO60318 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCM3APO60318 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCM3APO60318 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCM3APO60318 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCM3APO60318 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCM3APO60318 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCM3APO60318 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCM3APO60318 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MCM3APO60318 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCM3APO60318 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCM3APO60318 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCM3APO60318 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCM3APO60318 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCM3APO60318 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCM3APO60318 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MCM3APO60318 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM3APO60318 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms