Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP3B1O00203 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3B1O00203 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B1O00203 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
AP3B1O00203 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3B1O00203 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3B1O00203 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3B1O00203 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3B1O00203 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3B1O00203 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3B1O00203 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3B1O00203 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3B1O00203 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3B1O00203 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms