Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPIPA3F8WFD2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPA3F8WFD2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPIPA3F8WFD2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA3F8WFD2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA3F8WFD2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA3F8WFD2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA3F8WFD2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPIPA3F8WFD2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA3F8WFD2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA3F8WFD2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPA3F8WFD2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA3F8WFD2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA3F8WFD2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA3F8WFD2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPA3F8WFD2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA3F8WFD2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPIPA3F8WFD2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms