Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDZK1P1A8MUH7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZK1P1A8MUH7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZK1P1A8MUH7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZK1P1A8MUH7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms