Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPK0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPK0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PPK0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1W2PPK0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A1W2PPK0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A1W2PPK0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms