RNA–Protein interactions for RNA: YOR369C

RPS12, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS12, Length 432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS12	YOR369C	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
RPS12	YOR369C	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
RPS12	YOR369C	INO80	P53115	1489 aa		6.42	□□□□□ -1.38
RPS12	YOR369C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RPS12	YOR369C	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
RPS12	YOR369C	DNA2	P38859	1522 aa		6	□□□□□ -1.45
RPS12	YOR369C	KOG1	P38873	1557 aa		5.93	□□□□□ -1.46
RPS12	YOR369C	SWR1	Q05471	1514 aa		5.87	□□□□□ -1.47
RPS12	YOR369C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
RPS12	YOR369C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
RPS12	YOR369C	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
RPS12	YOR369C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPS12	YOR369C	SGS1	P35187	1447 aa		5.58	□□□□□ -1.52
RPS12	YOR369C	ECM5	Q03214	1411 aa		5.57	□□□□□ -1.52
RPS12	YOR369C	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
RPS12	YOR369C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
RPS12	YOR369C	MIF2	P35201	549 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RPS12	YOR369C	AVT3	P36062	692 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RPS12	YOR369C	BUD4	P47136	1447 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RPS12	YOR369C	HSL1	P34244	1518 aa		5.44	□□□□□ -1.54
RPS12	YOR369C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
RPS12	YOR369C	REV3	P14284	1504 aa		5.38	□□□□□ -1.55
RPS12	YOR369C	MDS3	P53094	1487 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPS12	YOR369C	TFA1	P36100	482 aa		5.32	□□□□□ -1.56
RPS12	YOR369C	HIR3	P47171	1648 aa		5.32	□□□□□ -1.56
RPS12	YOR369C	FAP1	P53971	965 aa		5.3	□□□□□ -1.56
RPS12	YOR369C	BPT1	P14772	1559 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RPS12	YOR369C	PEP1	P32319	1579 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RPS12	YOR369C	ISW2	Q08773	1120 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RPS12	YOR369C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
RPS12	YOR369C	YFR006W	P43590	535 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPS12	YOR369C	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
RPS12	YOR369C	TAF2	P23255	1407 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPS12	YOR369C	PRI1	P10363	409 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS12	YOR369C	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPS12	YOR369C	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPS12	YOR369C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RPS12	YOR369C	LTE1	P07866	1435 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPS12	YOR369C	MET5	P47169	1442 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPS12	YOR369C	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
RPS12	YOR369C	ATG2	P53855	1592 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RPS12	YOR369C	AAD16	Q02895	342 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RPS12	YOR369C	ITT1	Q04638	464 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RPS12	YOR369C	UFD4	P33202	1483 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPS12	YOR369C	SSK2	P53599	1579 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPS12	YOR369C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPS12	YOR369C	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS12	YOR369C	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS12	YOR369C	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPS12	YOR369C	CHD1	P32657	1468 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS12	YOR369C	MMS1	Q06211	1407 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPS12	YOR369C	DRS2	P39524	1355 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS12	YOR369C	CDC25	P04821	1589 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPS12	YOR369C	SIN3	P22579	1536 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS12	YOR369C	DNF1	P32660	1571 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS12	YOR369C	PAN1	P32521	1480 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS12	YOR369C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS12	YOR369C	YPK9	Q12697	1472 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS12	YOR369C	REB1	P21538	810 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS12	YOR369C	PRY3	P47033	881 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS12	YOR369C	SSN2	P38931	1420 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS12	YOR369C	TRM732	Q03496	1420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS12	YOR369C	RKR1	Q04781	1562 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS12	YOR369C	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS12	YOR369C	RPO31	P04051	1460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS12	YOR369C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS12	YOR369C	SCC2	Q04002	1493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS12	YOR369C	BNI1	P41832	1953 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS12	YOR369C	SPT21	P35209	758 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS12	YOR369C	ESP1	Q03018	1630 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS12	YOR369C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS12	YOR369C	MMS22	Q06164	1454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS12	YOR369C	VPS15	P22219	1454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS12	YOR369C	MET10	P39692	1035 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS12	YOR369C	NUP159	P40477	1460 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS12	YOR369C	RTT106	P40161	455 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS12	YOR369C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS12	YOR369C	RIM101	P33400	625 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS12	YOR369C	SPP41	P38904	1435 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS12	YOR369C	SMC4	Q12267	1418 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPS12	YOR369C	TSC11	P40061	1430 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	YCK3	P39962	524 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	SNT2	P53127	1403 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	STH1	P32597	1359 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	NUP170	P38181	1502 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	DNF2	Q12675	1612 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	TRM3	Q07527	1436 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	MRPL32	P25348	183 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	MYO4	P32492	1471 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPS12	YOR369C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS12	YOR369C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS12	YOR369C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS12	YOR369C	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPS12	YOR369C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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