Protein–RNA interactions for Protein: Q07527

TRM3, tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase, yeastyeast

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Length 1,436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM3Q07527 YML009W-BYML009W-B 477 nt30.88■■■□□ 2.53
TRM3Q07527 NOP1YDL014W 984 nt30.05■■■□□ 2.4
TRM3Q07527 NSR1YGR159C 1245 nt29.48■■■□□ 2.31
TRM3Q07527 YKL036CYKL036C 393 nt28.64■■■□□ 2.18
TRM3Q07527 YJL027CYJL027C 417 nt26.95■■□□□ 1.9
TRM3Q07527 SCS3YGL126W 1143 nt26.62■■□□□ 1.85
TRM3Q07527 Q0297Q0297 156 nt26.56■■□□□ 1.84
TRM3Q07527 SRX1YKL086W 384 nt26.3■■□□□ 1.8
TRM3Q07527 MDJ1YFL016C 1536 nt25.77■■□□□ 1.72
TRM3Q07527 YCR051WYCR051W 669 nt25.18■■□□□ 1.62
TRM3Q07527 YOL085CYOL085C 342 nt24.69■■□□□ 1.54
TRM3Q07527 PKP1YIL042C 1185 nt24.44■■□□□ 1.5
TRM3Q07527 SCJ1YMR214W 1134 nt24.37■■□□□ 1.49
TRM3Q07527 RPP1BYDL130W 321 nt23.88■■□□□ 1.41
TRM3Q07527 ATS1YAL020C 1002 nt23.86■■□□□ 1.41
TRM3Q07527 TRN1tP(UGG)A 72 nt23.37■■□□□ 1.33
TRM3Q07527 SUF9tP(UGG)F 72 nt23.37■■□□□ 1.33
TRM3Q07527 SUF8tP(UGG)H 72 nt23.37■■□□□ 1.33
TRM3Q07527 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt23.37■■□□□ 1.33
TRM3Q07527 SUF7tP(UGG)M 72 nt23.37■■□□□ 1.33
TRM3Q07527 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt23.37■■□□□ 1.33
TRM3Q07527 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt23.37■■□□□ 1.33
TRM3Q07527 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt23.37■■□□□ 1.33
TRM3Q07527 SUF11tP(UGG)O2 72 nt23.37■■□□□ 1.33
TRM3Q07527 CCC1YLR220W 969 nt23.18■■□□□ 1.3
TRM3Q07527 DBP2YNL112W 1641 nt22.91■■□□□ 1.26
TRM3Q07527 PET122YER153C 765 nt22.88■■□□□ 1.25
TRM3Q07527 SCR1SCR1 522 nt22.79■■□□□ 1.24
TRM3Q07527 RTC3YHR087W 336 nt22.41■■□□□ 1.18
TRM3Q07527 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt22.33■■□□□ 1.17
TRM3Q07527 RSB1YOR049C 1065 nt22.14■■□□□ 1.14
TRM3Q07527 RRN5YLR141W 1092 nt22.14■■□□□ 1.13
TRM3Q07527 PST2YDR032C 597 nt21.86■■□□□ 1.09
TRM3Q07527 RVS167YDR388W 1449 nt21.86■■□□□ 1.09
TRM3Q07527 YER088W-BYER088W-B 147 nt21.73■■□□□ 1.07
TRM3Q07527 YKL097CYKL097C 411 nt21.71■■□□□ 1.07
TRM3Q07527 YDJ1YNL064C 1230 nt21.47■■□□□ 1.03
TRM3Q07527 YBR190WYBR190W 312 nt21.45■■□□□ 1.02
TRM3Q07527 SHR5YOL110W 714 nt21.26■□□□□ 0.99
TRM3Q07527 GAR1YHR089C 618 nt21.05■□□□□ 0.96
TRM3Q07527 SHU1YHL006C 453 nt20.95■□□□□ 0.95
TRM3Q07527 YOR139CYOR139C 393 nt20.61■□□□□ 0.89
TRM3Q07527 DEP1YAL013W 1218 nt20.53■□□□□ 0.88
TRM3Q07527 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt20.43■□□□□ 0.86
TRM3Q07527 NPL3YDR432W 1245 nt20.35■□□□□ 0.85
TRM3Q07527 TIR1YER011W 765 nt20.25■□□□□ 0.83
TRM3Q07527 URN1YPR152C 1398 nt20.19■□□□□ 0.82
TRM3Q07527 YNL208WYNL208W 600 nt20.1■□□□□ 0.81
TRM3Q07527 RPN10YHR200W 807 nt20.07■□□□□ 0.8
TRM3Q07527 MNP1YGL068W 585 nt19.93■□□□□ 0.78
TRM3Q07527 SSA1YAL005C 1929 nt19.8■□□□□ 0.76
TRM3Q07527 YOL037CYOL037C 354 nt19.78■□□□□ 0.76
TRM3Q07527 SRB2YHR041C 633 nt19.75■□□□□ 0.75
TRM3Q07527 YGR021WYGR021W 873 nt19.68■□□□□ 0.74
TRM3Q07527 HOM6YJR139C 1080 nt19.64■□□□□ 0.73
TRM3Q07527 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt19.59■□□□□ 0.73
TRM3Q07527 IMT4tM(CAU)E 72 nt19.59■□□□□ 0.73
TRM3Q07527 IMT3tM(CAU)J3 72 nt19.59■□□□□ 0.73
TRM3Q07527 IMT1tM(CAU)O1 72 nt19.59■□□□□ 0.73
TRM3Q07527 IMT2tM(CAU)P 72 nt19.59■□□□□ 0.73
TRM3Q07527 WWM1YFL010C 636 nt19.57■□□□□ 0.72
TRM3Q07527 OPI9YLR338W 858 nt19.57■□□□□ 0.72
TRM3Q07527 RKM5YLR137W 1104 nt19.39■□□□□ 0.69
TRM3Q07527 MOT3YMR070W 1473 nt19.37■□□□□ 0.69
TRM3Q07527 BSC6YOL137W 1494 nt19.37■□□□□ 0.69
TRM3Q07527 SAH1YER043C 1350 nt19.33■□□□□ 0.69
TRM3Q07527 PUS2YGL063W 1113 nt19.27■□□□□ 0.68
TRM3Q07527 YJR018WYJR018W 363 nt19.23■□□□□ 0.67
TRM3Q07527 YJR120WYJR120W 351 nt19.2■□□□□ 0.66
TRM3Q07527 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt19.17■□□□□ 0.66
TRM3Q07527 RPP2BYDR382W 333 nt19.13■□□□□ 0.65
TRM3Q07527 YLR281CYLR281C 468 nt19.07■□□□□ 0.64
TRM3Q07527 PUN1YLR414C 792 nt19.07■□□□□ 0.64
TRM3Q07527 WHI5YOR083W 888 nt18.96■□□□□ 0.63
TRM3Q07527 FMP45YDL222C 930 nt18.94■□□□□ 0.62
TRM3Q07527 BDH2YAL061W 1254 nt18.84■□□□□ 0.61
TRM3Q07527 PUT4YOR348C 1884 nt18.81■□□□□ 0.6
TRM3Q07527 ARE1YCR048W 1833 nt18.8■□□□□ 0.6
TRM3Q07527 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt18.8■□□□□ 0.6
TRM3Q07527 SSA3YBL075C 1950 nt18.8■□□□□ 0.6
TRM3Q07527 YLR236CYLR236C 324 nt18.78■□□□□ 0.6
TRM3Q07527 MRPL8YJL063C 717 nt18.73■□□□□ 0.59
TRM3Q07527 DSK2YMR276W 1122 nt18.73■□□□□ 0.59
TRM3Q07527 PTC2YER089C 1395 nt18.68■□□□□ 0.58
TRM3Q07527 YCH1YGR203W 447 nt18.64■□□□□ 0.57
TRM3Q07527 YPR011CYPR011C 981 nt18.61■□□□□ 0.57
TRM3Q07527 LSM3YLR438C-A 270 nt18.58■□□□□ 0.57
TRM3Q07527 UBX6YJL048C 1191 nt18.54■□□□□ 0.56
TRM3Q07527 YBL100CYBL100C 315 nt18.51■□□□□ 0.55
TRM3Q07527 ADO1YJR105W 1023 nt18.48■□□□□ 0.55
TRM3Q07527 IMP2'YIL154C 1041 nt18.46■□□□□ 0.55
TRM3Q07527 BUD23YCR047C 828 nt18.42■□□□□ 0.54
TRM3Q07527 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt18.42■□□□□ 0.54
TRM3Q07527 YEL076CYEL076C 651 nt18.42■□□□□ 0.54
TRM3Q07527 YLR464WYLR464W 651 nt18.42■□□□□ 0.54
TRM3Q07527 FPR4YLR449W 1179 nt18.4■□□□□ 0.54
TRM3Q07527 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt18.38■□□□□ 0.53
TRM3Q07527 POA1YBR022W 534 nt18.38■□□□□ 0.53
TRM3Q07527 LPX1YOR084W 1164 nt18.36■□□□□ 0.53
TRM3Q07527 FIS1YIL065C 468 nt18.32■□□□□ 0.52
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