RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	YPR109W	Q06104	294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
snR46	snR46	HED1	Q03937	162 aa		4.57	□□□□□ -1.68
snR46	snR46	ORC6	P38826	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
snR46	snR46	YDR444W	Q04093	687 aa		4.56	□□□□□ -1.68
snR46	snR46	ENV9	Q08651	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
snR46	snR46	COX6	P00427	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
snR46	snR46	VPS70	P47161	811 aa		4.54	□□□□□ -1.68
snR46	snR46	HST3	P53687	447 aa		4.54	□□□□□ -1.68
snR46	snR46	RGR1	P19263	1082 aa		4.53	□□□□□ -1.68
snR46	snR46	ASH1	P34233	588 aa		4.53	□□□□□ -1.68
snR46	snR46	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
snR46	snR46	KEX2	P13134	814 aa		4.52	□□□□□ -1.69
snR46	snR46	ERF2	Q06551	359 aa		4.5	□□□□□ -1.69
snR46	snR46	PUS5	Q06244	254 aa		4.49	□□□□□ -1.69
snR46	snR46	YPR148C	Q06523	435 aa		4.49	□□□□□ -1.69
snR46	snR46	AFT1	P22149	690 aa		4.48	□□□□□ -1.69
snR46	snR46	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
snR46	snR46	MET32	Q12041	191 aa		4.48	□□□□□ -1.69
snR46	snR46	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
snR46	snR46	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
snR46	snR46	YJR115W	P47152	169 aa		4.44	□□□□□ -1.7
snR46	snR46	TUB4	P53378	473 aa		4.44	□□□□□ -1.7
snR46	snR46	MOD5	P07884	428 aa		4.43	□□□□□ -1.7
snR46	snR46	YDL176W	Q12027	708 aa		4.42	□□□□□ -1.7
snR46	snR46	KXD1	P53158	218 aa		4.41	□□□□□ -1.7
snR46	snR46	CLB5	P30283	435 aa		4.4	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	SRF1	Q12516	437 aa		4.4	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	UGA3	P26370	528 aa		4.39	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	CAF120	P53836	1060 aa		4.39	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	YNL115C	P53925	644 aa		4.39	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	AGE1	Q04412	482 aa		4.39	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	PBS2	P08018	668 aa		4.38	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	MTC5	Q03897	1148 aa		4.38	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	YLR346C	Q06139	101 aa		4.38	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	RTF1	P53064	558 aa		4.37	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	KIP2	P28743	706 aa		4.35	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	HXT10	P43581	546 aa		4.35	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	CKB1	P43639	278 aa		4.35	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	TEA1	P47988	759 aa		4.34	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	OPT2	Q06593	877 aa		4.34	□□□□□ -1.71
snR46	snR46	TRK2	P28584	889 aa		4.33	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	MAM3	Q12296	706 aa		4.33	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	SLY41	P22215	453 aa		4.32	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	ACO2	P39533	789 aa		4.32	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	YGR035C	P53222	116 aa		4.31	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	SIT4	P20604	311 aa		4.3	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	TPD3	P31383	635 aa		4.3	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	IXR1	P33417	597 aa		4.3	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	TBF1	Q02457	562 aa		4.3	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	SCW11	P53189	542 aa		4.29	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	NIS1	P53939	407 aa		4.29	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.29	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	ALR1	Q08269	859 aa		4.29	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	MIP1	P15801	1254 aa		4.28	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	IES2	P40154	320 aa		4.28	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	NUP85	P46673	744 aa		4.28	□□□□□ -1.72
snR46	snR46	PUS6	P53294	404 aa		4.27	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	YIR007W	P40566	764 aa		4.26	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	HPF1	Q05164	967 aa		4.26	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	YDL206W	Q12424	762 aa		4.26	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	RPA14	P50106	137 aa		4.25	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	FPK1	P53739	893 aa		4.24	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	UBP2	Q01476	1272 aa		4.24	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	ARG82	P07250	355 aa		4.23	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	RTT106	P40161	455 aa		4.23	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	LSC2	P53312	427 aa		4.23	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.23	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.23	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
snR46	snR46	DSF2	P38213	736 aa		4.21	□□□□□ -1.74
snR46	snR46	ICP55	P40051	511 aa		4.21	□□□□□ -1.74
snR46	snR46	SCJ1	P25303	377 aa		4.2	□□□□□ -1.74
snR46	snR46	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
snR46	snR46	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.2	□□□□□ -1.74
snR46	snR46	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
snR46	snR46	DIT2	P21595	489 aa		4.19	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.8 ms