RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	CKB1	P43639	278 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	SEC2	P17065	759 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	ERG12	P07277	443 aa		3.23	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	CST6	P40535	587 aa		3.23	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	ERF2	Q06551	359 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	KEX2	P13134	814 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	RRN7	P40992	514 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	CLA4	P48562	842 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	KOG1	P38873	1557 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	IES2	P40154	320 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	MAM3	Q12296	706 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	LAM6	Q08001	693 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	DSF2	P38213	736 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	BDP1	P46678	594 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	INO80	P53115	1489 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	CLB5	P30283	435 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	DIT2	P21595	489 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	DNA2	P38859	1522 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTI1	YKL033W	BRE2	P43132	505 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	TUB4	P53378	473 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	TEA1	P47988	759 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	AGE1	Q04412	482 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	CDC4	P07834	779 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	NIS1	P53939	407 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	PUS5	Q06244	254 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	RGA1	P39083	1007 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	YNL115C	P53925	644 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	SIT4	P20604	311 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	GCR2	Q01722	534 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	MOD5	P07884	428 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	RTF1	P53064	558 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	HED1	Q03937	162 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	YMR196W	Q04336	1088 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	FPK1	P53739	893 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	SLY41	P22215	453 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	MET32	Q12041	191 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	SCJ1	P25303	377 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	not detected
TTI1	YKL033W	ASH1	P34233	588 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	KXD1	P53158	218 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTI1	YKL033W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	MET22	P32179	357 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	ATF2	P53296	535 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	HST3	P53687	447 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	RGA2	Q06407	1009 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	HXT10	P43581	546 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	TBF1	Q02457	562 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	YPL062W	Q02781	134 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	GLC3	P32775	704 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	YDL206W	Q12424	762 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	AFT1	P22149	690 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	ESS1	P22696	170 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	PUS6	P53294	404 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	HSL1	P34244	1518 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	HST2	P53686	357 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	ALR1	Q08269	859 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	MMP1	Q12372	583 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	YJR115W	P47152	169 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	YDR444W	Q04093	687 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	TPD3	P31383	635 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	RPA14	P50106	137 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	ENV9	Q08651	330 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	SSK2	P53599	1579 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	KIP2	P28743	706 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	YPR097W	Q06839	1073 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	YJU3	P28321	313 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
TTI1	YKL033W	IXR1	P33417	597 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTI1	YKL033W	PEP1	P32319	1579 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TTI1	YKL033W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.02	□□□□□ -1.93	not detected
TTI1	YKL033W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTI1	YKL033W	UGA3	P26370	528 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TTI1	YKL033W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TTI1	YKL033W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
TTI1	YKL033W	ITT1	Q04638	464 aa		3	□□□□□ -1.93

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