RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeastyeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POP4YBR257W PRT1P06103 763 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
POP4YBR257W PBS2P08018 668 aa9.47□□□□□ -0.89
POP4YBR257W SEC2P17065 759 aa9.46□□□□□ -0.9
POP4YBR257W CKB1P43639 278 aa9.45□□□□□ -0.9
POP4YBR257W YPR109WQ06104 294 aa9.44□□□□□ -0.9
POP4YBR257W DSF2P38213 736 aa9.36□□□□□ -0.91
POP4YBR257W CST6P40535 587 aa9.36□□□□□ -0.91
POP4YBR257W ERF2Q06551 359 aa9.36□□□□□ -0.91
POP4YBR257W YEL077CQ3E7X8 1277 aa9.36□□□□□ -0.91
POP4YBR257W GCD11P32481 527 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
POP4YBR257W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
POP4YBR257W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
POP4YBR257W NPL4P33755 580 aa9.34□□□□□ -0.91
POP4YBR257W IES2P40154 320 aa9.34□□□□□ -0.91
POP4YBR257W MAM3Q12296 706 aa9.33□□□□□ -0.92
POP4YBR257W TRK1P12685 1235 aa9.32□□□□□ -0.92
POP4YBR257W KEX2P13134 814 aa9.32□□□□□ -0.92
POP4YBR257W CLA4P48562 842 aa9.31□□□□□ -0.92
POP4YBR257W NUP42P49686 430 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
POP4YBR257W LAM6Q08001 693 aa9.29□□□□□ -0.92
POP4YBR257W RRN7P40992 514 aa9.28□□□□□ -0.92
POP4YBR257W ERG12P07277 443 aa9.26□□□□□ -0.93
POP4YBR257W AIR1P40507 360 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
POP4YBR257W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
POP4YBR257W AGE1Q04412 482 aa9.23□□□□□ -0.93
POP4YBR257W PAC1P39946 494 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
POP4YBR257W DIT2P21595 489 aa9.21□□□□□ -0.94
POP4YBR257W CLB5P30283 435 aa9.2□□□□□ -0.94
POP4YBR257W BDP1P46678 594 aa9.2□□□□□ -0.94
POP4YBR257W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
POP4YBR257W MOD5P07884 428 aa9.16□□□□□ -0.94
POP4YBR257W SIT4P20604 311 aa9.16□□□□□ -0.94
POP4YBR257W NIS1P53939 407 aa9.16□□□□□ -0.94
POP4YBR257W TUB4P53378 473 aa9.15□□□□□ -0.94
POP4YBR257W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
POP4YBR257W TEA1P47988 759 aa9.12□□□□□ -0.95
POP4YBR257W RTF1P53064 558 aa9.12□□□□□ -0.95
POP4YBR257W PAT1P25644 796 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
POP4YBR257W YNL115CP53925 644 aa9.11□□□□□ -0.95
POP4YBR257W CDC4P07834 779 aa9.07□□□□□ -0.96
POP4YBR257W BRE2P43132 505 aa9.06□□□□□ -0.96
POP4YBR257W FPK1P53739 893 aa9.04□□□□□ -0.96
POP4YBR257W HED1Q03937 162 aa9.04□□□□□ -0.96
POP4YBR257W PUS5Q06244 254 aa9.03□□□□□ -0.96
POP4YBR257W MET32Q12041 191 aa9.02□□□□□ -0.97
POP4YBR257W PDC1P06169 563 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
POP4YBR257W SLY41P22215 453 aa8.97□□□□□ -0.97
POP4YBR257W SCJ1P25303 377 aa8.97□□□□□ -0.97
POP4YBR257W TPD3P31383 635 aa8.96□□□□□ -0.98
POP4YBR257W RRD1P40454 393 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
POP4YBR257W YMR196WQ04336 1088 aa8.94□□□□□ -0.98
POP4YBR257W GLC3P32775 704 aa8.93□□□□□ -0.98
POP4YBR257W HST2P53686 357 aa8.93□□□□□ -0.98
POP4YBR257W HXT10P43581 546 aa8.92□□□□□ -0.98
POP4YBR257W KXD1P53158 218 aa8.91□□□□□ -0.98
POP4YBR257W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
POP4YBR257W ASH1P34233 588 aa8.9□□□□□ -0.98
POP4YBR257W GCR2Q01722 534 aa8.9□□□□□ -0.98
POP4YBR257W TRM1P15565 570 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
POP4YBR257W YDL206WQ12424 762 aa8.89□□□□□ -0.99
POP4YBR257W AFT1P22149 690 aa8.88□□□□□ -0.99
POP4YBR257W MET22P32179 357 aa8.87□□□□□ -0.99
POP4YBR257W RPA14P50106 137 aa8.86□□□□□ -0.99
POP4YBR257W PUS6P53294 404 aa8.86□□□□□ -0.99
POP4YBR257W ATF2P53296 535 aa8.86□□□□□ -0.99
POP4YBR257W YPL062WQ02781 134 aa8.86□□□□□ -0.99
POP4YBR257W ESS1P22696 170 aa8.85□□□□□ -0.99
POP4YBR257W YPR097WQ06839 1073 aa8.85□□□□□ -0.99
POP4YBR257W MMP1Q12372 583 aa8.85□□□□□ -0.99
POP4YBR257W KTR1P27810 393 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
POP4YBR257W YJU3P28321 313 aa8.83□□□□□ -1
POP4YBR257W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
POP4YBR257W GAR1P28007 205 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
POP4YBR257W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data8.82□□□□□ -1not detected
POP4YBR257W GLN1P32288 370 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
POP4YBR257W TBF1Q02457 562 aa8.81□□□□□ -1
POP4YBR257W ALR1Q08269 859 aa8.81□□□□□ -1
POP4YBR257W ENV9Q08651 330 aa8.81□□□□□ -1
POP4YBR257W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
POP4YBR257W YJR115WP47152 169 aa8.79□□□□□ -1
POP4YBR257W HST3P53687 447 aa8.79□□□□□ -1
POP4YBR257W RSC30P38781 883 aa8.78□□□□□ -1
POP4YBR257W AIM7Q12156 149 aa8.76□□□□□ -1.01
POP4YBR257W YDR444WQ04093 687 aa8.75□□□□□ -1.01
POP4YBR257W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
POP4YBR257W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
POP4YBR257W MRT4P33201 236 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
POP4YBR257W YDL176WQ12027 708 aa8.72□□□□□ -1.01
POP4YBR257W IXR1P33417 597 aa8.71□□□□□ -1.02
POP4YBR257W KIP2P28743 706 aa8.7□□□□□ -1.02
POP4YBR257W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
POP4YBR257W VAC17P25591 423 aa8.69□□□□□ -1.02
POP4YBR257W ITT1Q04638 464 aa8.69□□□□□ -1.02
POP4YBR257W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data8.66□□□□□ -1.02not detected
POP4YBR257W PTK2P47116 818 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
POP4YBR257W CSN12P47130 423 aa8.65□□□□□ -1.02
POP4YBR257W UGA3P26370 528 aa8.63□□□□□ -1.03
POP4YBR257W ARG8P18544 423 aa8.62□□□□□ -1.03
POP4YBR257W FIG4P42837 879 aa8.61□□□□□ -1.03
POP4YBR257W RAD59Q12223 238 aa8.6□□□□□ -1.03
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