RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeastyeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POP4YBR257W MTC1P47018 478 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
POP4YBR257W DRS1P32892 752 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
POP4YBR257W FAP1P53971 965 aa16.49■□□□□ 0.23
POP4YBR257W PRY3P47033 881 aa15.63■□□□□ 0.09
POP4YBR257W PRI1P10363 409 aa15.3■□□□□ 0.04
POP4YBR257W AAD16Q02895 342 aa15.16■□□□□ 0.02
POP4YBR257W ISW2Q08773 1120 aa14.91□□□□□ -0.02
POP4YBR257W RPG1P38249 964 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
POP4YBR257W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
POP4YBR257W YCK3P39962 524 aa14.71□□□□□ -0.05
POP4YBR257W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
POP4YBR257W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
POP4YBR257W AVT3P36062 692 aa14.27□□□□□ -0.13
POP4YBR257W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
POP4YBR257W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
POP4YBR257W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
POP4YBR257W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
POP4YBR257W MRPL32P25348 183 aa13.78□□□□□ -0.2
POP4YBR257W REB1P21538 810 aa13.71□□□□□ -0.21
POP4YBR257W SPT21P35209 758 aa13.35□□□□□ -0.27
POP4YBR257W CDC27P38042 758 aa13.26□□□□□ -0.29
POP4YBR257W YGL015CP33199 130 aa13.23□□□□□ -0.29
POP4YBR257W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
POP4YBR257W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
POP4YBR257W HOP09932 586 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4YBR257W TFC8Q12308 588 aa12.89□□□□□ -0.35
POP4YBR257W DCD1P06773 312 aa12.87□□□□□ -0.35
POP4YBR257W RIM101P33400 625 aa12.81□□□□□ -0.36
POP4YBR257W MAP2P38174 421 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
POP4YBR257W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
POP4YBR257W SCY1P53009 804 aa12.5□□□□□ -0.41
POP4YBR257W BCH2P36122 765 aa12.46□□□□□ -0.41
POP4YBR257W OXP1P28273 1286 aa12.43□□□□□ -0.42
POP4YBR257W SLX5P32828 619 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
POP4YBR257W TFA1P36100 482 aa12.21□□□□□ -0.45
POP4YBR257W TGL3P40308 642 aa12.17□□□□□ -0.46
POP4YBR257W SIS1P25294 352 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
POP4YBR257W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
POP4YBR257W EPS1P40557 701 aa12.14□□□□□ -0.47
POP4YBR257W BDF1P35817 686 aa12.09□□□□□ -0.47
POP4YBR257W PTP3P40048 928 aa12.09□□□□□ -0.47
POP4YBR257W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
POP4YBR257W RSM7P47150 247 aa11.96□□□□□ -0.49
POP4YBR257W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
POP4YBR257W AI2P03876 854 aa11.87□□□□□ -0.51
POP4YBR257W YLR271WQ06152 274 aa11.82□□□□□ -0.52
POP4YBR257W BBC1P47068 1157 aa11.79□□□□□ -0.52
POP4YBR257W UBP9P39967 754 aa11.73□□□□□ -0.53
POP4YBR257W MST1P07236 462 aa11.72□□□□□ -0.53
POP4YBR257W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data11.67□□□□□ -0.54not detected
POP4YBR257W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
POP4YBR257W YOR238WQ08634 303 aa11.6□□□□□ -0.55
POP4YBR257W SSP1P38871 571 aa11.58□□□□□ -0.56
POP4YBR257W YBL029C-AQ3E756 94 aa11.53□□□□□ -0.56
POP4YBR257W YAP5P40574 245 aa11.52□□□□□ -0.57
POP4YBR257W MRM1P25270 412 aa11.45□□□□□ -0.58
POP4YBR257W CST9Q06032 482 aa11.42□□□□□ -0.58
POP4YBR257W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data11.42□□□□□ -0.58not detected
POP4YBR257W VNX1P42839 908 aa11.4□□□□□ -0.58
POP4YBR257W PIB1Q06651 286 aa11.32□□□□□ -0.6
POP4YBR257W WSC3Q12215 556 aa11.32□□□□□ -0.6
POP4YBR257W MGA2P40578 1113 aa11.29□□□□□ -0.6
POP4YBR257W VPS29P38759 282 aa11.24□□□□□ -0.61
POP4YBR257W GTT3P39996 337 aa11.23□□□□□ -0.61
POP4YBR257W SPP1Q03012 353 aa11.23□□□□□ -0.61
POP4YBR257W RCR1P38212 213 aa11.18□□□□□ -0.62
POP4YBR257W TIF11P38912 153 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
POP4YBR257W STS1P38637 319 aa11.15□□□□□ -0.62
POP4YBR257W RTG3P38165 486 aa11.14□□□□□ -0.63
POP4YBR257W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data11.14□□□□□ -0.63not detected
POP4YBR257W DBP1P24784 617 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
POP4YBR257W YFR006WP43590 535 aa11.12□□□□□ -0.63
POP4YBR257W FKH1P40466 484 aa11.08□□□□□ -0.64
POP4YBR257W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
POP4YBR257W IOC2Q12072 812 aa11.05□□□□□ -0.64
POP4YBR257W YOL036WQ08206 761 aa11.03□□□□□ -0.64
POP4YBR257W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
POP4YBR257W ULI1P43604 169 aa11.02□□□□□ -0.65
POP4YBR257W LDB19Q12502 818 aa11.01□□□□□ -0.65
POP4YBR257W MSB4Q12317 492 aa11□□□□□ -0.65
POP4YBR257W SET4P42948 560 aa10.99□□□□□ -0.65
POP4YBR257W SAM3Q08986 587 aa10.96□□□□□ -0.65
POP4YBR257W TRP5P00931 707 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
POP4YBR257W EAP1P36041 632 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
POP4YBR257W RAM2P29703 316 aa10.81□□□□□ -0.68
POP4YBR257W RTG1P32607 177 aa10.81□□□□□ -0.68
POP4YBR257W YJL171CP46992 396 aa10.79□□□□□ -0.68
POP4YBR257W GYP5Q12344 894 aa10.75□□□□□ -0.69
POP4YBR257W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
POP4YBR257W BMT6Q12291 365 aa10.73□□□□□ -0.69
POP4YBR257W MAK11P20484 414 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
POP4YBR257W EDS1P38073 919 aa10.7□□□□□ -0.7
POP4YBR257W DAN4P47179 1161 aa10.7□□□□□ -0.7
POP4YBR257W SEC61P32915 480 aa10.69□□□□□ -0.7
POP4YBR257W NCR1Q12200 1170 aa10.69□□□□□ -0.7
POP4YBR257W DCW1P36091 449 aa10.68□□□□□ -0.7
POP4YBR257W ABP1P15891 592 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
POP4YBR257W HTA1P04911 132 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
POP4YBR257W HTA2P04912 132 aa10.64□□□□□ -0.71
POP4YBR257W MIF2P35201 549 aa10.61□□□□□ -0.71
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