RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109241.4

Snx18-201, Transcript of Sorting nexin-18, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Snx18, Length 4,447 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18-201ENSMUST00000109241 Kdm2aP59997 1161 aa20.31■□□□□ 0.84
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa20.31■□□□□ 0.84
Snx18-201ENSMUST00000109241 Plekhh2Q8C115 1491 aa20.3■□□□□ 0.84
Snx18-201ENSMUST00000109241 Spryd3E9Q9B3 442 aa20.29■□□□□ 0.84
Snx18-201ENSMUST00000109241 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Snx18-201ENSMUST00000109241 Grin2bQ01097 1482 aa20.29■□□□□ 0.84
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa20.28■□□□□ 0.84
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ppm1gQ61074 542 aa20.28■□□□□ 0.84
Snx18-201ENSMUST00000109241 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Snx18-201ENSMUST00000109241 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Snx18-201ENSMUST00000109241 Htatsf1Q8BGC0 757 aa20.26■□□□□ 0.83
Snx18-201ENSMUST00000109241 Plcb2A3KGF7 1181 aa20.25■□□□□ 0.83
Snx18-201ENSMUST00000109241 Usp47Q8BY87 1376 aa20.23■□□□□ 0.83
Snx18-201ENSMUST00000109241 Vps8Q0P5W1 1427 aa20.23■□□□□ 0.83
Snx18-201ENSMUST00000109241 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Snx18-201ENSMUST00000109241 Tiam1Q60610 1591 aa20.21■□□□□ 0.83
Snx18-201ENSMUST00000109241 Armcx1Q9CX83 456 aa20.21■□□□□ 0.83
Snx18-201ENSMUST00000109241 Duox2A2AQ99 1517 aa20.21■□□□□ 0.83
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cux1P53564 1515 aa20.21■□□□□ 0.83
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gm20521D3Z5F7 333 aa20.18■□□□□ 0.82
Snx18-201ENSMUST00000109241 WrnO09053 1401 aa20.18■□□□□ 0.82
Snx18-201ENSMUST00000109241 Fgd1P52734 960 aa20.18■□□□□ 0.82
Snx18-201ENSMUST00000109241 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Snx18-201ENSMUST00000109241 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Snx18-201ENSMUST00000109241 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rad54l2Q99NG0 1466 aa20.16■□□□□ 0.82
Snx18-201ENSMUST00000109241 Chmp5Q9D7S9 219 aa20.15■□□□□ 0.82
Snx18-201ENSMUST00000109241 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Snx18-201ENSMUST00000109241 Camsap1A2AHC3 1581 aa20.14■□□□□ 0.81
Snx18-201ENSMUST00000109241 Wdr62Q3U3T8 1523 aa20.13■□□□□ 0.81
Snx18-201ENSMUST00000109241 AknaQ80VW7 1404 aa20.13■□□□□ 0.81
Snx18-201ENSMUST00000109241 CatipB9EKE5 520 aa20.11■□□□□ 0.81
Snx18-201ENSMUST00000109241 PtmaP26350 111 aa20.11■□□□□ 0.81
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa20.11■□□□□ 0.81
Snx18-201ENSMUST00000109241 Zscan21Q07231 555 aa20.11■□□□□ 0.81
Snx18-201ENSMUST00000109241 Lamc3Q9R0B6 1581 aa20.09■□□□□ 0.81
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ipo9Q91YE6 1041 aa20.08■□□□□ 0.81
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rwdd1Q9CQK7 243 aa20.08■□□□□ 0.81
Snx18-201ENSMUST00000109241 Dnai1Q8C0M8 701 aa20.07■□□□□ 0.8
Snx18-201ENSMUST00000109241 Stk24Q99KH8 431 aa20.07■□□□□ 0.8
Snx18-201ENSMUST00000109241 Znf710Q3U288 666 aa20.07■□□□□ 0.8
Snx18-201ENSMUST00000109241 Plppr3Q7TPB0 716 aa20.05■□□□□ 0.8
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Snx18-201ENSMUST00000109241 IqubQ8CDK3 788 aa20.04■□□□□ 0.8
Snx18-201ENSMUST00000109241 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
Snx18-201ENSMUST00000109241 ChgaP26339 463 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rock2P70336 1388 aa20.01■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gm6268A2A3U9 297 aa20■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 AU015836B2RUM3 263 aa20■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Tmf1B9EKI3 1091 aa20■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa20■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Zfp644E9QA22 1323 aa19.99■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Tdrd9Q14BI7 1383 aa19.98■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Dapk1Q80YE7 1442 aa19.98■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cnga1P29974 684 aa19.97■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa19.97■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Irx6Q9ER75 438 aa19.97■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Pcf11G3X9Z4 1553 aa19.97■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa19.96■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ift140E9PY46 1464 aa19.96■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 EspnQ9ET47 871 aa19.96■□□□□ 0.79
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa19.95■□□□□ 0.78
Snx18-201ENSMUST00000109241 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
Snx18-201ENSMUST00000109241 Srcin1Q9QWI6 1250 aa19.93■□□□□ 0.78
Snx18-201ENSMUST00000109241 Stag3O70576 1240 aa19.92■□□□□ 0.78
Snx18-201ENSMUST00000109241 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa19.92■□□□□ 0.78
Snx18-201ENSMUST00000109241 CadpsQ80TJ1 1355 aa19.91■□□□□ 0.78
Snx18-201ENSMUST00000109241 Map7O88735 730 aa19.91■□□□□ 0.78
Snx18-201ENSMUST00000109241 Naip2Q9QUK4 1447 aa19.9■□□□□ 0.78
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ncoa2Q61026 1462 aa19.9■□□□□ 0.78
Snx18-201ENSMUST00000109241 PrkcshO08795 521 aa19.9■□□□□ 0.78
Snx18-201ENSMUST00000109241 Jph4Q80WT0 628 aa19.89■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 Arid3cA6PWV5 409 aa19.88■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 Lemd3Q9WU40 921 aa19.88■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa19.86■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa19.86■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ecm2Q5FW85 670 aa19.86■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa19.85■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ankrd26Q811D2 1581 aa19.85■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 Slc4a1apE9PX68 744 aa19.85■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 Pank3Q8R2W9 370 aa19.84■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 Kif3bQ61771 747 aa19.84■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cluap1Q8R3P7 413 aa19.84■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 CrbnQ8C7D2 445 aa19.84■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 SynmQ70IV5 1561 aa19.84■□□□□ 0.77
Snx18-201ENSMUST00000109241 Dcaf11Q91VU6 549 aa19.82■□□□□ 0.76
Snx18-201ENSMUST00000109241 Erich6bQ9D4S6 220 aa19.82■□□□□ 0.76
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ipo8Q7TMY7 1010 aa19.81■□□□□ 0.76
Snx18-201ENSMUST00000109241 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
Snx18-201ENSMUST00000109241 TnnQ80Z71 1560 aa19.81■□□□□ 0.76
Snx18-201ENSMUST00000109241 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa19.8■□□□□ 0.76
Snx18-201ENSMUST00000109241 A2mQ6GQT1 1474 aa19.8■□□□□ 0.76
Snx18-201ENSMUST00000109241 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
Snx18-201ENSMUST00000109241 Slx4Q6P1D7 1565 aa19.79■□□□□ 0.76
Snx18-201ENSMUST00000109241 Inpp5dQ9ES52 1191 aa19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 91.1 ms