Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PrkcshO08795 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PrkcshO08795 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PrkcshO08795 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PrkcshO08795 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PrkcshO08795 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PrkcshO08795 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PrkcshO08795 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PrkcshO08795 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PrkcshO08795 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
PrkcshO08795 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PrkcshO08795 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PrkcshO08795 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PrkcshO08795 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PrkcshO08795 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PrkcshO08795 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PrkcshO08795 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PrkcshO08795 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PrkcshO08795 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PrkcshO08795 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PrkcshO08795 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PrkcshO08795 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PrkcshO08795 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PrkcshO08795 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PrkcshO08795 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PrkcshO08795 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PrkcshO08795 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PrkcshO08795 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PrkcshO08795 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PrkcshO08795 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PrkcshO08795 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PrkcshO08795 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PrkcshO08795 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PrkcshO08795 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PrkcshO08795 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PrkcshO08795 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PrkcshO08795 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PrkcshO08795 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PrkcshO08795 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PrkcshO08795 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PrkcshO08795 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PrkcshO08795 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PrkcshO08795 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PrkcshO08795 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PrkcshO08795 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PrkcshO08795 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PrkcshO08795 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PrkcshO08795 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PrkcshO08795 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PrkcshO08795 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PrkcshO08795 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PrkcshO08795 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PrkcshO08795 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PrkcshO08795 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PrkcshO08795 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PrkcshO08795 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PrkcshO08795 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PrkcshO08795 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PrkcshO08795 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PrkcshO08795 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PrkcshO08795 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PrkcshO08795 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PrkcshO08795 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PrkcshO08795 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PrkcshO08795 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PrkcshO08795 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PrkcshO08795 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PrkcshO08795 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PrkcshO08795 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PrkcshO08795 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PrkcshO08795 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PrkcshO08795 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PrkcshO08795 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PrkcshO08795 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PrkcshO08795 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PrkcshO08795 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PrkcshO08795 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PrkcshO08795 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PrkcshO08795 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PrkcshO08795 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PrkcshO08795 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PrkcshO08795 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PrkcshO08795 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PrkcshO08795 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PrkcshO08795 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PrkcshO08795 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PrkcshO08795 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PrkcshO08795 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PrkcshO08795 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PrkcshO08795 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PrkcshO08795 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PrkcshO08795 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PrkcshO08795 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PrkcshO08795 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PrkcshO08795 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PrkcshO08795 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PrkcshO08795 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PrkcshO08795 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PrkcshO08795 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PrkcshO08795 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms