Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC57.77■■■■■ 6.84
Vps8Q0P5W1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC53.59■■■■■ 6.17
Vps8Q0P5W1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.63■■■■■ 6.02
Vps8Q0P5W1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC50.35■■■■■ 5.65
Vps8Q0P5W1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC50.21■■■■■ 5.63
Vps8Q0P5W1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.61
Vps8Q0P5W1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC49.22■■■■■ 5.47
Vps8Q0P5W1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
Vps8Q0P5W1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
Vps8Q0P5W1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
Vps8Q0P5W1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.42■■■■■ 5.34
Vps8Q0P5W1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
Vps8Q0P5W1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC48.14■■■■■ 5.3
Vps8Q0P5W1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
Vps8Q0P5W1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Vps8Q0P5W1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC46.88■■■■■ 5.09
Vps8Q0P5W1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
Vps8Q0P5W1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46.61■■■■■ 5.05
Vps8Q0P5W1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC46.57■■■■■ 5.05
Vps8Q0P5W1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
Vps8Q0P5W1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Vps8Q0P5W1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC46.3■■■■■ 5
Vps8Q0P5W1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC46.3■■■■■ 5
Vps8Q0P5W1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
Vps8Q0P5W1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
Vps8Q0P5W1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Vps8Q0P5W1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
Vps8Q0P5W1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
Vps8Q0P5W1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Vps8Q0P5W1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Vps8Q0P5W1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
Vps8Q0P5W1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
Vps8Q0P5W1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Vps8Q0P5W1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
Vps8Q0P5W1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
Vps8Q0P5W1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
Vps8Q0P5W1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Vps8Q0P5W1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
Vps8Q0P5W1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
Vps8Q0P5W1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Vps8Q0P5W1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Vps8Q0P5W1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Vps8Q0P5W1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Vps8Q0P5W1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Vps8Q0P5W1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC44.37■■■■■ 4.69
Vps8Q0P5W1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
Vps8Q0P5W1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
Vps8Q0P5W1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Vps8Q0P5W1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Vps8Q0P5W1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Vps8Q0P5W1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
Vps8Q0P5W1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Vps8Q0P5W1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Vps8Q0P5W1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
Vps8Q0P5W1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
Vps8Q0P5W1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Vps8Q0P5W1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Vps8Q0P5W1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Vps8Q0P5W1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Vps8Q0P5W1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Vps8Q0P5W1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
Vps8Q0P5W1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
Vps8Q0P5W1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
Vps8Q0P5W1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
Vps8Q0P5W1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Vps8Q0P5W1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Vps8Q0P5W1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
Vps8Q0P5W1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
Vps8Q0P5W1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Vps8Q0P5W1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Vps8Q0P5W1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
Vps8Q0P5W1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Vps8Q0P5W1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
Vps8Q0P5W1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
Vps8Q0P5W1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Vps8Q0P5W1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Vps8Q0P5W1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Vps8Q0P5W1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Vps8Q0P5W1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
Vps8Q0P5W1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Vps8Q0P5W1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Vps8Q0P5W1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Vps8Q0P5W1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Vps8Q0P5W1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.64■■■■■ 4.42
Vps8Q0P5W1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
Vps8Q0P5W1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Vps8Q0P5W1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Vps8Q0P5W1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Vps8Q0P5W1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Vps8Q0P5W1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Vps8Q0P5W1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Vps8Q0P5W1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
Vps8Q0P5W1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Vps8Q0P5W1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
Vps8Q0P5W1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
Vps8Q0P5W1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Vps8Q0P5W1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Vps8Q0P5W1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Vps8Q0P5W1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Vps8Q0P5W1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms