Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Gtf3c3Q3TMP1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Gtf3c3Q3TMP1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Gtf3c3Q3TMP1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Gtf3c3Q3TMP1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Gtf3c3Q3TMP1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Gtf3c3Q3TMP1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Gtf3c3Q3TMP1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Gtf3c3Q3TMP1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Gtf3c3Q3TMP1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gtf3c3Q3TMP1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gtf3c3Q3TMP1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Gtf3c3Q3TMP1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Gtf3c3Q3TMP1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Gtf3c3Q3TMP1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Gtf3c3Q3TMP1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Gtf3c3Q3TMP1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Gtf3c3Q3TMP1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Gtf3c3Q3TMP1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Gtf3c3Q3TMP1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Gtf3c3Q3TMP1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Gtf3c3Q3TMP1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Gtf3c3Q3TMP1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Gtf3c3Q3TMP1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Gtf3c3Q3TMP1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Gtf3c3Q3TMP1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gtf3c3Q3TMP1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Gtf3c3Q3TMP1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Gtf3c3Q3TMP1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Gtf3c3Q3TMP1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Gtf3c3Q3TMP1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Gtf3c3Q3TMP1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Gtf3c3Q3TMP1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Gtf3c3Q3TMP1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Gtf3c3Q3TMP1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gtf3c3Q3TMP1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Gtf3c3Q3TMP1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Gtf3c3Q3TMP1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Gtf3c3Q3TMP1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gtf3c3Q3TMP1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Gtf3c3Q3TMP1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gtf3c3Q3TMP1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Gtf3c3Q3TMP1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Gtf3c3Q3TMP1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Gtf3c3Q3TMP1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Gtf3c3Q3TMP1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Gtf3c3Q3TMP1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Gtf3c3Q3TMP1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Gtf3c3Q3TMP1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Gtf3c3Q3TMP1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Gtf3c3Q3TMP1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Gtf3c3Q3TMP1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Gtf3c3Q3TMP1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gtf3c3Q3TMP1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Gtf3c3Q3TMP1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Gtf3c3Q3TMP1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gtf3c3Q3TMP1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Gtf3c3Q3TMP1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Gtf3c3Q3TMP1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms