Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE6

Ipo9, Importin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo9Q91YE6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Ipo9Q91YE6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Ipo9Q91YE6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Ipo9Q91YE6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Ipo9Q91YE6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Ipo9Q91YE6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Ipo9Q91YE6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
Ipo9Q91YE6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ipo9Q91YE6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ipo9Q91YE6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ipo9Q91YE6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ipo9Q91YE6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ipo9Q91YE6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Ipo9Q91YE6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ipo9Q91YE6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ipo9Q91YE6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ipo9Q91YE6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ipo9Q91YE6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ipo9Q91YE6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ipo9Q91YE6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ipo9Q91YE6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ipo9Q91YE6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Ipo9Q91YE6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ipo9Q91YE6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ipo9Q91YE6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ipo9Q91YE6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ipo9Q91YE6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Ipo9Q91YE6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ipo9Q91YE6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ipo9Q91YE6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ipo9Q91YE6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ipo9Q91YE6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ipo9Q91YE6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ipo9Q91YE6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ipo9Q91YE6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ipo9Q91YE6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Ipo9Q91YE6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ipo9Q91YE6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ipo9Q91YE6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ipo9Q91YE6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ipo9Q91YE6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ipo9Q91YE6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ipo9Q91YE6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Ipo9Q91YE6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Ipo9Q91YE6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ipo9Q91YE6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ipo9Q91YE6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ipo9Q91YE6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ipo9Q91YE6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ipo9Q91YE6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ipo9Q91YE6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ipo9Q91YE6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ipo9Q91YE6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ipo9Q91YE6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Ipo9Q91YE6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ipo9Q91YE6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ipo9Q91YE6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ipo9Q91YE6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ipo9Q91YE6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ipo9Q91YE6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ipo9Q91YE6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Ipo9Q91YE6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ipo9Q91YE6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ipo9Q91YE6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ipo9Q91YE6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ipo9Q91YE6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ipo9Q91YE6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ipo9Q91YE6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ipo9Q91YE6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Ipo9Q91YE6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ipo9Q91YE6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ipo9Q91YE6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ipo9Q91YE6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ipo9Q91YE6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ipo9Q91YE6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ipo9Q91YE6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ipo9Q91YE6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ipo9Q91YE6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Ipo9Q91YE6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ipo9Q91YE6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ipo9Q91YE6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ipo9Q91YE6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ipo9Q91YE6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ipo9Q91YE6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ipo9Q91YE6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Ipo9Q91YE6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Ipo9Q91YE6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ipo9Q91YE6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ipo9Q91YE6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ipo9Q91YE6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ipo9Q91YE6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ipo9Q91YE6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ipo9Q91YE6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ipo9Q91YE6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ipo9Q91YE6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ipo9Q91YE6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ipo9Q91YE6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Ipo9Q91YE6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ipo9Q91YE6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ipo9Q91YE6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms